Das Max-Planck-Institut für Herz- und Lungenforschung steht unter der kollegialen Leitung der vier Direktoren Thomas Braun, Stefan Offermanns, Didier Stainier und Werner Seeger. Sie tragen gemeinschaftlich die Verantwortung für die wissenschaftliche und verwaltende Leitung des Instituts. Die laufenden Geschäfte führt der aus dem Kreis der Direktoren auf Zeit bestimmte Geschäftsführende Direktor. Vom 1. Juli 2017 bis 30. Juni 2020 nimmt diese Funktion Prof. Dr. Dr. Thomas Braun wahr.
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