Das Max-Planck-Institut für Herz- und Lungenforschung steht unter der kollegialen Leitung der vier Direktoren Thomas Braun, Stefan Offermanns, Didier Stainier und Werner Seeger. Sie tragen gemeinschaftlich die Verantwortung für die wissenschaftliche und verwaltende Leitung des Instituts. Die laufenden Geschäfte führt der aus dem Kreis der Direktoren auf Zeit bestimmte Geschäftsführende Direktor. Derzeit nimmt diese Funktion  Prof. Dr. Stefan Offermanns wahr.

Das Direktorium wird zur Erfüllung seiner satzungsgemässen Aufgaben vom Direktionsassistenten Dr. Matthias Heil und der wissenschaftlich-administrativen Koordinatorin Dr. Susanne Schneider unterstützt.

Das nachfolgende Organigramm veranschaulicht die aktuelle Struktur des Max-Planck-Instituts (zum Vergößern bitte anklicken):